MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrobacter winogradskyi Nb-255 chromosome

Total Repeats: 69778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007406	CTG	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674200
2	NC_007406	GATC	2	8	794	801	25 %	25 %	25 %	25 %	75674200
3	NC_007406	TGCGC	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	75674200
4	NC_007406	GC	3	6	861	866	0 %	0 %	50 %	50 %	75674200
5	NC_007406	GTTGA	2	10	897	906	20 %	40 %	40 %	0 %	75674200
6	NC_007406	CGG	2	6	950	955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674200
7	NC_007406	CGG	2	6	1024	1029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674200
8	NC_007406	CGGCG	2	10	1050	1059	0 %	0 %	60 %	40 %	75674200
9	NC_007406	CTG	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674200
10	NC_007406	CGG	2	6	1180	1185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674200
11	NC_007406	TCG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674200
12	NC_007406	CGA	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674200
13	NC_007406	GCC	2	6	1354	1359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674200
14	NC_007406	GGT	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674200
15	NC_007406	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674200
16	NC_007406	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674200
17	NC_007406	CGG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674200
18	NC_007406	GAG	2	6	1467	1472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674200
19	NC_007406	TCGGC	2	10	1475	1484	0 %	20 %	40 %	40 %	75674200
20	NC_007406	GCC	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674200
21	NC_007406	CCA	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75674200
22	NC_007406	GTCC	2	8	1686	1693	0 %	25 %	25 %	50 %	75674200
23	NC_007406	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674200
24	NC_007406	GTG	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674200
25	NC_007406	GCC	2	6	1867	1872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674200
26	NC_007406	CAC	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75674200
27	NC_007406	TGC	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674200
28	NC_007406	ACG	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674200
29	NC_007406	CGA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674200
30	NC_007406	CTG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674200
31	NC_007406	CG	3	6	2229	2234	0 %	0 %	50 %	50 %	75674201
32	NC_007406	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674201
33	NC_007406	CGG	2	6	2277	2282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674201
34	NC_007406	CGATCT	2	12	2351	2362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75674201
35	NC_007406	GGC	2	6	2381	2386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674201
36	NC_007406	CAT	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674201
37	NC_007406	GC	3	6	2461	2466	0 %	0 %	50 %	50 %	75674201
38	NC_007406	CGGC	2	8	2572	2579	0 %	0 %	50 %	50 %	75674201
39	NC_007406	GATC	2	8	2627	2634	25 %	25 %	25 %	25 %	75674201
40	NC_007406	TAT	2	6	2670	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75674201
41	NC_007406	AAC	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674201
42	NC_007406	GCG	2	6	2728	2733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674201
43	NC_007406	CGAC	2	8	2737	2744	25 %	0 %	25 %	50 %	75674201
44	NC_007406	TCA	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674201
45	NC_007406	GCAAG	2	10	2885	2894	40 %	0 %	40 %	20 %	75674201
46	NC_007406	CGT	2	6	2915	2920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674201
47	NC_007406	AAC	2	6	2979	2984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674201
48	NC_007406	GTC	2	6	2997	3002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674201
49	NC_007406	AAG	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75674201
50	NC_007406	CGA	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674201
51	NC_007406	AGCG	2	8	3051	3058	25 %	0 %	50 %	25 %	75674201
52	NC_007406	GAG	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674201
53	NC_007406	ATTCA	2	10	3182	3191	40 %	40 %	0 %	20 %	75674201
54	NC_007406	CGC	2	6	3209	3214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674201
55	NC_007406	GC	3	6	3295	3300	0 %	0 %	50 %	50 %	75674201
56	NC_007406	TCCC	2	8	3408	3415	0 %	25 %	0 %	75 %	75674202
57	NC_007406	CGC	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
58	NC_007406	CCGCG	2	10	3453	3462	0 %	0 %	40 %	60 %	75674202
59	NC_007406	GCA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674202
60	NC_007406	GCT	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674202
61	NC_007406	CG	3	6	3571	3576	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
62	NC_007406	CGA	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674202
63	NC_007406	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674202
64	NC_007406	GC	3	6	3641	3646	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
65	NC_007406	CGGC	2	8	3705	3712	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
66	NC_007406	GCC	2	6	3745	3750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
67	NC_007406	GGC	2	6	3827	3832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674202
68	NC_007406	CTG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674202
69	NC_007406	CAC	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75674202
70	NC_007406	CCG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
71	NC_007406	GCGGTC	2	12	3988	3999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75674202
72	NC_007406	GCG	2	6	4000	4005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674202
73	NC_007406	GC	4	8	4008	4015	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
74	NC_007406	GC	3	6	4048	4053	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
75	NC_007406	CTC	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75674202
76	NC_007406	TGGA	2	8	4099	4106	25 %	25 %	50 %	0 %	75674202
77	NC_007406	GCT	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674202
78	NC_007406	TGG	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674202
79	NC_007406	GC	3	6	4164	4169	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
80	NC_007406	GCC	2	6	4172	4177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
81	NC_007406	CGC	3	9	4185	4193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
82	NC_007406	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75674202
83	NC_007406	AGG	2	6	4265	4270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674202
84	NC_007406	CGCC	2	8	4320	4327	0 %	0 %	25 %	75 %	75674202
85	NC_007406	CAT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674202
86	NC_007406	GCT	4	12	4356	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674202
87	NC_007406	CCG	2	6	4398	4403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
88	NC_007406	GTT	2	6	4410	4415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75674202
89	NC_007406	GCG	2	6	4454	4459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674202
90	NC_007406	GCC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
91	NC_007406	CCGG	2	8	4517	4524	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
92	NC_007406	CG	3	6	4529	4534	0 %	0 %	50 %	50 %	75674202
93	NC_007406	GCC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674202
94	NC_007406	GAAC	2	8	4814	4821	50 %	0 %	25 %	25 %	75674203
95	NC_007406	GCA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674203
96	NC_007406	CAC	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75674203
97	NC_007406	CGA	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674203
98	NC_007406	CCG	2	6	5026	5031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674203
99	NC_007406	CGA	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674203
100	NC_007406	CGG	2	6	5122	5127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
101	NC_007406	TCA	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674203
102	NC_007406	CGG	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
103	NC_007406	CGG	2	6	5192	5197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
104	NC_007406	CGGCGT	2	12	5204	5215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75674203
105	NC_007406	CGT	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
106	NC_007406	GTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
107	NC_007406	GCG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
108	NC_007406	GAT	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75674203
109	NC_007406	GGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
110	NC_007406	CAA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674203
111	NC_007406	TGG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674203
112	NC_007406	TGG	2	6	5631	5636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674203
113	NC_007406	CAA	2	6	5672	5677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674203
114	NC_007406	CGG	2	6	5693	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
115	NC_007406	AAG	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75674203
116	NC_007406	CGA	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674203
117	NC_007406	TCG	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
118	NC_007406	GTC	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
119	NC_007406	TCA	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674203
120	NC_007406	CGC	2	6	5927	5932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674203
121	NC_007406	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674203
122	NC_007406	CCGA	2	8	5949	5956	25 %	0 %	25 %	50 %	75674203
123	NC_007406	TCG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
124	NC_007406	GGT	2	6	5978	5983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75674203
125	NC_007406	CGG	2	6	5992	5997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674203
126	NC_007406	CG	3	6	5998	6003	0 %	0 %	50 %	50 %	75674203
127	NC_007406	CG	3	6	6008	6013	0 %	0 %	50 %	50 %	75674203
128	NC_007406	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	75674203
129	NC_007406	TCG	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
130	NC_007406	CGGC	2	8	6136	6143	0 %	0 %	50 %	50 %	75674203
131	NC_007406	GC	5	10	6218	6227	0 %	0 %	50 %	50 %	75674203
132	NC_007406	GTC	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
133	NC_007406	ATC	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674203
134	NC_007406	TGA	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75674203
135	NC_007406	CCGACG	2	12	6346	6357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	75674203
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137	NC_007406	GCT	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674203
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249	NC_007406	GCC	2	6	12180	12185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674210
250	NC_007406	CGA	2	6	12200	12205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674210
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258	NC_007406	GCC	2	6	12473	12478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674210
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260	NC_007406	GC	3	6	12604	12609	0 %	0 %	50 %	50 %	75674210
261	NC_007406	CGCCC	2	10	12662	12671	0 %	0 %	20 %	80 %	75674210
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263	NC_007406	CAG	2	6	12687	12692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674210
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266	NC_007406	GCG	2	6	12747	12752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674210
267	NC_007406	GC	4	8	12773	12780	0 %	0 %	50 %	50 %	75674210
268	NC_007406	CAT	2	6	12832	12837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674210
269	NC_007406	GGGA	2	8	12854	12861	25 %	0 %	75 %	0 %	75674211
270	NC_007406	ACG	2	6	12897	12902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674211
271	NC_007406	GC	3	6	12905	12910	0 %	0 %	50 %	50 %	75674211
272	NC_007406	CTG	2	6	13121	13126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75674211
273	NC_007406	GCG	2	6	13155	13160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674211
274	NC_007406	GGA	2	6	13183	13188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674211
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276	NC_007406	CGGCG	2	10	13200	13209	0 %	0 %	60 %	40 %	75674211
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283	NC_007406	ATC	2	6	13590	13595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674212
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285	NC_007406	GATCTC	2	12	13642	13653	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75674212
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289	NC_007406	ATC	2	6	13761	13766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674212
290	NC_007406	CG	3	6	13837	13842	0 %	0 %	50 %	50 %	75674212
291	NC_007406	ATC	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674212
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299	NC_007406	GAG	2	6	14223	14228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674213
300	NC_007406	ATC	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674213
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303	NC_007406	ATC	3	9	14278	14286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75674213
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395	NC_007406	CGG	2	6	17858	17863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674216
396	NC_007406	GTCG	2	8	17880	17887	0 %	25 %	50 %	25 %	75674216
397	NC_007406	CGC	2	6	17958	17963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75674216
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400	NC_007406	CG	3	6	18013	18018	0 %	0 %	50 %	50 %	75674216
401	NC_007406	CGG	2	6	18144	18149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75674217
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433	NC_007406	GCA	2	6	20315	20320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674218
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495	NC_007406	CGA	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75674221
496	NC_007406	CAA	2	6	23196	23201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75674221
497	NC_007406	TCGC	2	8	23209	23216	0 %	25 %	25 %	50 %	75674221
498	NC_007406	CTCGC	2	10	23245	23254	0 %	20 %	20 %	60 %	75674221
499	NC_007406	GACATC	2	12	23269	23280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75674221
500	NC_007406	AGG	2	6	23291	23296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75674221

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